化石蛋是游戏后期推进剧情的关键道具，获取方式涉及多个场景的联动解谜。化石蛋位于船上甲板处，需要通过将蓝色羽毛交给西装男子后获得。蓝色羽毛的获取需先完成灯塔解密、工厂探索等前置任务，最终在码头售票处二楼与小男孩互动时，从八音盒中取得。这一系列操作要求玩家对游戏地图和物品联动有清晰认知。
工厂大门密码需通过解谜开启，进入后找到碾压机操作台。将化石蛋放置于操作台上启动机器，可将其压碎并获得种子。种子的用途与时间线切换相关，需返回过去时间线交给海边男孩，再切换至现在时间线观察其生长状态。此过程体现了游戏核心的时间穿梭机制，需注意场景切换的时机。
种子的种植结果直接影响火箭区域的解锁。在现在时间线中，种子已长成大树，玩家需攀爬至悬崖顶部。此处需结合外星人停尸间墙壁的线索输入密码，才能打开火箭舱门。火箭内部包含关键道具异形块和小红花，这些物品与后续神庙解密直接关联。化石蛋的完整使用链条至此才完全展现。
神庙区域的最终解密需依赖化石蛋衍生的金色石饼。返回工厂No.09房间，根据停尸间线索摆放物品后，地面会出现圆形凹槽。放入石饼可获得金色石饼道具，将其带回神庙一楼石室内部激活墙壁图案。需结合石像眼睛的方位线索调整机关，最终取得蓝色菱形能量块。这一步骤是通关的必要条件。
能量块需放置于火箭一层的能量炉中，并根据石柱阵的线索调整仪表板。完成所有操作后与宇航员对话即可启动火箭，实现一周目通关。化石蛋作为贯穿中后期的核心道具，其获取与使用流程充分体现了迷失岛2谜题设计的环环相扣特性，建议玩家在探索时注意记录每个环节的线索。
